notice

wp_enqueue_script позволяет подключить тэг в хэдер или футер и указать зависимости, например:

function addMyScript() {
    wp_enqueue_script( 'custom-main', get_template_directory_uri() 
            . '/js/custom/main.js', array ( 'jquery' ), 1.1, true);
}
add_action('wp_head', 'addMyScript');

-- а данном случае мы указываем, что наш скрипт зависит от jquery.