Предположим, что вы восстанавливаете доступ к системе - ну и там была зашифрованная домашняя директория, но вы не помните старый пароль, сменили его на новый, но войти в систему не получается - так как экран входа показывается заново даже при вводе правильного пароля -
это не страшно.
Если в домашней директории было что-то ценное - вспоминайте пароль, если пароль вы знаете - сделайте резервную копию домашней в расшифрованном виде.
