В убунту для php можно обнаружить как минимум два конфигурационных файла:
- cli/php.ini -- отвечате за конфигруацию в режиме командной строки -- об этом можно узнать так
- apache2/php.ini -- за работу php в связке с apache -- этот выдаст phpinfo() при обращении через http. Конкретный адрес может быть, например таким:
/etc/php/5.6/apache2/php.ini
Или для другой версии php:
