Используя пункт из главного меню:
Window -> Document Groups
Можно создавать новые группы вкладок (открытых файлов) и сохранять их, когда вы закрываете вкладки в открытом наборе изменения сохраняются в той группе, которая активна. Между группами можно переключаться в этой же ветке меню.
Создавать новые группы:
Window -> Document Groups -> New Document Group
И управлять существующими: