Прежде всего убедитесь, что git status говорит, что коммитить нечего (это же относится и к правке файла gitattributes, если он у вас есть - закоммитьте его изменения, если требуется):
On branch ....
Your branch is up to date with ...
nothing to commit, working tree clean
Затем чтобы обновить все файлы из истории коммитов (как в последнем коммите, с учетом текущих настроек, напр. из .gitattributes) :