Общая идея проста, заводим файл, который импортирует из других файлов, напр. со содержимым:
import {hello1} from "./mod1";
import {hello2} from "./mod2";
hello1();
hello2();
пусть его имя main.js (mod1.js и mod2.js два файла лежащие на том же уровне и экспортирующие указанные переменные типа "функция").
Далее в webpack.config.js напишем что-то вроде: