Переходим в папку, которую хотим сделать репозиторием и выполняем команду git init:
cd /path/to/your/project
git init
где /path/to/your/project -- путь к папке с проектом, который надо поставить под контроль версий ( на вашем компе)
Указать центральное хранилище (origin)
Затем можно указать где распологается главное хранилище, на гитхабе (github) для этого испольузйте команда формата:
git remote add origin https://github.com/username/reposname.git