apt delete repository

Возможно, прежде чем удалять репозиторий, вам захочется посмотреть имеющиеся.

-- после чего можно удалить:

• или ненужные строки из файла из /etc/apt/sources.list
• и/или ненужные файлы из директории /etc/apt/sources.list.d/

После удаления репозитория, также можно удалить его ключ из списка доверенных (если этот ключ добавлялся).