Virtualbox

Virtualbox можно установить из репозитория командой:

sudo apt-get install virtualbox

Совета по решению проблемы пока не дам -- здесь просто расматривается вопрос можно ли выключать машину

Можно ли выключать виртуальную машину

По-идее в этой стадии все файлы уже должны быть сохранены (в отличии от этой ситуации), а потому можно "железно" вырубить виртуалку (из главного меню):

Machine -> Reset

Если Ubuntu висит с логотипом и мигает лампочками --- то нажмите Esc (эскейп) и увидите что происходит.

Возможно, проблема в том, что происходит завершение служб -- если они висят, то то будут завершены по таймауту.

Например в моём случаем на завершение mySQL (видимо, зависшей) было выделено 5 минут 7 секунд.

Описание проблемы

В моё случае проблема оказалась в использовании NetBeans, которая (как выяснилось после перезапуска этой IDE) съела всю память. Как минимум проблема была связана с этим поеданием памяти.
Проблема наблюдалась не только в netBeans но и в браузере.

Решение

Убедитесь, что никакая программа в виртуальной машине не съедает всю память. В моём случае помог перезапуск NetBeans (и/или дайте виртуальной машине больше оперативной памяти в её настройках)

Ситуация

Предположим, что буфер обмена у вас работал и вот после очередного восстановления сохранённого состояния виртуальной машины работать внезапно перестал.

Рассмотрим два решения этой проблемы.
(в моём случае гостевой системой была ubuntu, а хостовой win7)

Без переустановки/перезагрузки

Перезагрузим процесс внутри гостевой ОС, отвечающие в т.ч. за бфер обмена (двумя командами в терминале ubuntu):

killall VBoxClient
VBoxClient-all

Или сразу одной командой:

Virtualbox -- удобное средство для поддержки виртуальных машин с самыми разными ОС в самых разных реальных ОС.