Используйте флаги (перенос строки заэкранирован):
-a --delete-after --verbose \
--progress --omit-dir-times --no-perms --recursive --inplace
работает нормально (синхронизирует) но с предупреждением типа "rsync: failed to set times on"
Пример команды (многострочная, переносы строк заэкранированы, можно копировать в таком же виде сразу все строки, и просто заменить пути на свои):
