SyntaxError: missing ) after argument list
Возможное решение
Используйте вместо команды вида:
node --require ts-node/register ./node_modules/.bin/fixtures --config src/typeorm-config.ts ./fixtures
Команду вида:
node --require ts-node/register ./node_modules/typeorm-fixtures-cli/dist/cli.js --config src/typeorm-config.ts ./fixtures
-- т.е. на windows (одновремиенно с linux) будет работать путь