Если с помощью $this->registerCssFile() файлы со стилями подключаются дважды, убедитесь, что у вас только один раз вызывается: (например, в файле шаблона --layout):
<?php $this->head() ?>
-- если же данный вызов происходит более 1 раза, то значит то именно этот вызов и дублирует подклюение CSS.
