Правой кнопкой кликаем на папку репозитория и выбираем:
Tortoisegit ->
Settings ->
далее слева кликните по пункту :
Git
и выберете для Cofig Source переключатель:
Local
снимите галочки inherit с полей Name и Email и укажите в них нужные вам значения, а затем нажмите кнопку "Применить".