Error: Error when deleting document: 6 network error while attempting to run command 'getlasterror' on host 'localhost:27017'
В чем причина не выяснил -- но со следующей попытки удалить получилось
Robomongo -- Хороший графический клиент для mongoDB.
Можно установить с сайта: https://robomongo.org/
