php Ограничение на число переменных в POST запросе - многомерный массив приходит не полностью

Проблема наблюдается в PHP5.5

В php.ini следует проверить число доступных уровней вложения и число переменных, правда они по-умолчанию достаточно велики:

max_input_nesting_level = 64
max_input_vars = 1000

Т.е. скорее всего просто убедитесь в корректности своего кода.