Если не использовать флаг --append, то можно получить ошибку вида, при загрузке связанной сущности -- даже если SQL отработает, класс не загрузится:
[Symfony\Component\Debug\Exception\FatalThrowableError]
Type error: Argument 1 passed to ...\Entity\User::addGroup() must be an instance of ...., null given, called in
Поэтому надо выполнять команду в формате:
bin/console doctrine:fixtures:load [класс] --append
Пример загрузчика фикстуры:
