mysqldump

Если ответ при создании дампа ответ вроде того:

-bash: (имя_файла,_куда_предполагалось_положить_дамп):
     Permission denied

-- то есть не от самой утилиты дампа, то у вас просто нет права на запись -- перейтиде в другую папку и повторите команду снова.

mysqldump: Couldn't find table: ";"
mysqldump: Got error: 1064: You have an error in your SQL syntax;
 check the manual that corresponds to your MySQL server version for
 the right syntax to use near '' at line 1 when doing LOCK TABLES

Ошибка может возникать, если в конце команды создания дампа стоит точка с запятой то есть вместо такого (правильно):

mysqldump -u root -p -f  biopulse  >  D:/dumps/database.sql

так (что неправильно):